蝴蝶兰的花芽和气根的区别主要在于生长部位、生长方向、外形差异和功用差异等。花芽是长在叶腋间的，向上生长，呈淡紫色，有小节，而气根是生长在基部和茎干上，无固定方向，外形呈白色，能够吸收养分和水分。

1、生长部位

花芽和气根在初生出来时确实一时间让人难以区分，但其实二者生长的位置的不同就能够揭示各自的身份，花芽只会生长在叶腋之间，在叶片的夹缝中生长，但气根则是生长在植株的基部和主干上，区别还是非常明显的。

2、生长方向

蝴蝶兰的气根的生长方向和花芽的生长方向是不同的，这一点在各自长到一定的大小之后就能很容易区分开来了，气根的生长是没有固定的方向的，但总体是往下，花芽则是笔直的向上生长，向着有光照的地方生长。

3、外形差异

气根和花芽的外形在初期难以辨别，但再长大一点差异就比较明显了，气根的颜色一般是白色，少数有淡绿色或葱白色的气根，而花芽的颜色则是紫色或是淡紫色，颜色很浓，且花芽长有一段段的小节，气根只是一根根须。

4、功用不同

气根是蝴蝶兰这种气生兰所独有的器官之一，它是在土壤中的养分、水分、氧气等不足的情况下或是植株的长势过于旺盛的情况下为蝴蝶兰摄取空气中的水分和养分的器官，而花箭则是蝴蝶兰用以抽生孕育花朵的器官。