生产三系杂交稻种子需要雄性不育、雄性不育维持和雄性不育恢复。不育系的不育是由细胞质和细胞核共同控制的，需要与维持系杂交才能获得不育系种子；不育系和恢复系杂交，获得杂交稻种子供田间生产和应用；维持系和恢复系的自交种子仍然可以作为 生产三系杂交稻种子需要雄性不育、雄性不育维持和雄性不育恢复。不育系的不育受细胞质和细胞核的共同控制，需要与维持系杂交才能获得不育系种子；不育系和恢复系杂交，获得杂交稻种子供田间生产应用；维持系和恢复系的自交种子仍可作为维持系和恢复系。 生产两系杂交水稻只需要不育和恢复。不育系的育性由细胞核内隐性不育基因和种植环境的光长和温度共同控制，随着光和温度条件的变化，从不育到可育的育性转化与细胞质无关。利用光温敏感不育系随光温条件的变化而产生的育性转化特性，在适宜的光温时期可以自交繁殖种子，三系不育系必须按一定行比种植，依靠保持粉异交生产不育系种子。与三系杂交水稻一样，两系杂交水稻的杂种优势表现和机制是利用两种遗传形成不同的亲本杂交产生一代杂交种子，并利用生产中的杂种优势。