看均匀度。与其他水稻混合的杂交稻种子形状不规则。杂交父本或其他籼稻种子明显比杂交稻种子细长饱满，而粳稻种子则较圆润。

二是看糠色。杂交水稻种子的糠壳有略微不均匀的黄褐色等生理杂色，而父本和保持系的颜色比较一致。保持系等杂粮比杂交水稻种子透明，谷壳比杂交水稻种子透明。种子光滑。

第三，看柱头的痕迹。由于非杂交稻粒多为自花授粉，雌蕊柱头不外露，柱头痕迹留在糠壳内。剥去糠壳后，米粒顶部可见少许淡黑色的柱头痕迹。杂交种异花授粉，柱头暴露。仔细观察谷粒内外稃之间的缝隙，可以发现一个小黑点，就是柱头的痕迹。这是鉴定杂交水稻种子和其他水稻籽粒的重要依据。

四、看染色测定。方法是将稻壳从胚上纵向切成两半，每粒洗净一半用稀释至60倍的红墨液浸泡，1小时后取出用清水洗净，若种子胚未染色或染色较浅，证明种子是活的；如果颜色变深，则证明种子已经失去了活力。以这种方式，可以识别杂交种子中未发芽的变质种子。

第五，看种子的纯度。用手抄种子，手掌上手指间有泥土、沙子等固体颗粒，手指沾有细粉，证明种子纯度不符合国家标准（99 %)。

六、看种子的含水量。简单的方法是用牙齿咬谷物。如果有尖锐的声音，说明含水量基本正常；如果没有尖锐的声音或谷粒的横截面不规则，则种子的含水量一般高于正常标准（11.5%）。

七看种子“三证”。凡有种子经营许可证、质量合格证和植保部门病虫害检疫证书的种子，均为优质杂交水稻种子。否则就是假冒伪劣的杂交水稻种子。