1）选择抗病品种：不同的大豆品种对大豆花叶病的抗性不同，因此选择适宜当地抗病品种是防治大豆花叶病最有效的措施。抗病品种有祁黄22、芦豆4号、芦豆1号、芦豆7号、芦豆6号、禾84-2、禾7308-1-2、卫87、炎黄3号等，这些品种增产效果明显，可因地制宜选择。

2）选种、淘汰田间病苗：用健株留种田，结合防治蚜虫，培育无病种子。对于一般种子，播种前应去除褐斑，减少种传病原菌，减少田间病害传染源。

3）防蚜防病：在开花前，特别是苗期防治蚜虫，可减少病毒病在田间的进一步传播。播种土壤后，避免种子与农药接触。 苗期或成株期喷40%氧化乐果乳油1000-2000倍液或5%来福林乳油2000-3000倍液，或20%氯菊酯乳油或2.5%乐果乳油3000倍液，喷药液40-50公斤每亩药量。