西瓜的常见病害有猝倒病、炭疽病、蔓枯病、疫病、叶枯病、枯萎病、细菌果斑病等。西瓜蔓枯病又被称作黑腐病，属于真菌病害，又称“流黄水病”，在西瓜一整个生长期都是会病发，随后造成叶子和蔓枯死，和果子烂掉。叶枯病属于真菌病害，西瓜叶枯病通常伤害西瓜的叶部，叶子病发初期，在叶边会产生水浸状小点，随后扩大到一整片叶子后变枯。

细菌果斑病为细菌病害，可危害西瓜叶、果等。叶子病发，近叶脉上有水渍状色斑，病斑沿叶脉而生，斑型细长；果子病发，生不规律的大型的橄榄色水浸状斑点，末期外果皮开裂，容易和其它病害混发。疫病为甜瓜疫霉真菌，可在西瓜全生育期产生危害，但成株期病发更重。叶子受害叶边生水渍状病斑，病况发展飞快，边沿不显著，湿度过大时可烂掉，变枯时叶脆易裂。