水竹的主要病害有锈病、胡麻斑病和纹枯病。必须防治水竹病害农业在预防和控制的基础上，实施综合治理。选择抗病品种，做好冬季花园清理工作，合理密集种植，加强肥料和水管理，人工剥离黄叶和病叶，合理预防和控制药物，并在发病初期进行喷洒保护。

20%三唑酮(2500倍)可用于防治锈病。、敌力脱(3000倍)25%、福星40%(8000倍)、40%多·硫(400倍)等。，可以选择25%使百克(200000倍)防治胡麻病斑～3000倍）、70%的安泰生(800倍)、50%扑海因(1000倍)、世高10%(2000倍)等。5%井岗霉素(1000倍)用于防治纹枯病。

一种黑粉病寄生在水竹茎中， 在水竹节繁殖时，产生生长素分泌物，刺激薄壁组织的生长，使茎膨胀成水竹。因此，在水竹怀孕期间，应谨慎使用杀菌剂，特别是三唑类杀菌剂。