(1)菌丝体不能在土层上生长，主要是由于培养物发酵过度或部分生长，或培养物和覆盖土的pH值不合适；或覆土后喷水过多，菌丝流入料层时收缩或死亡。栽培方面，应通过加强通风、调节PH值、物料水分过多等补救措施。

(2)高温死菇。由于高温高湿，菇蕾变黄或枯死。管理上采取加强通风、停止喷水、降低室温等措施，减少死菇。

(3)密菇主要是堆料太稀或太干造成的；或覆土过薄，菌丝从细土渗出，管理不善，造成菌丝活力弱，出菇密集，菇体小，品质差。因此，应采取追肥保土、保持常温等措施，防止密菇。

(4)硬开伞。由于气温下降或昼夜温差大，空气干燥，或堆肥过于潮湿等原因，造成菌丝活力弱，使未成熟的子实体易出现硬开伞。常采用保温增加空气湿度等方法，防止硬降落伞的发生。

(5)畸形菇由于覆土过厚、土粒过大、细土覆盖过晚、湿度过大、通风不良等原因，常会出现一些畸形菇。主要防治措施是土粒大小合适，覆土及时，土层不宜过厚，其次加强浇水和通风管理。

(6)气温高、供水不足和温度低时，菇体生长缓慢，菇体在菇床内停留时间过长，会出现白心现象。主要通过加强温湿度管理来预防。