辣椒早疫病和晚疫病的病原体不同；辣椒早疫病的病原菌是Alternaria solani。辣椒晚疫病的病原菌是辣椒疫霉。 辣椒早疫病和晚疫病的区别苗期病害特点不同；辣椒早疫病多发生在辣椒幼苗3-5叶期，引起叶尖和顶芽腐烂，形成光顶苗。辣椒晚疫病的特点是茎基部呈深绿色水浸软腐病或立枯病，故又称苗猝倒病。成人阶段的疾病特点不同；辣椒早疫病叶片受害后，病初为水浸黑褐色小斑点，后扩大为圆形或椭圆形；茎呈灰褐色椭圆形，受损后略凹陷。辣椒晚疫病叶片染病后，出现边缘不明显的脏褐色斑点，病叶迅速腐烂脱落；成为“黑棒”。辣椒早疫病和晚疫病的防治辣椒早疫病防治方法：选择抗病品种，种植在地势高、向阳的田地，以利雨季排水。平时注意田间通风，降低温度和湿度，发现病叶及时摘除，深埋田间。种子消毒可用50%多菌灵500-600倍液浸泡20分钟，然后用清水冲洗干净，晒干播种。喷洒控制可用72%锰锌乳膏尿素可湿性粉剂600倍液、72%克康灵可湿性粉剂600倍液等药剂控制。 7-10天喷一次，连续控制2-3次。防治辣椒晚疫病的方法：实行轮作，增施有机肥、磷钾肥和微肥，并施适量氮肥，改良土壤结构。管理时要尽量减少人为机械损伤，避免造成伤口。茎部若有感病，可用70%代森锰锌液200倍液涂抹病斑。可用25%甲霜灵可湿性粉剂700倍液浇灌病穴及周围植物。每株药水用量250g，浇水次数1-2次，间隔5-7天。发病初期可用72%谷氨酸可湿性粉剂500倍液防治。